Todos os cursos oferecidos pela FUNCESI são autorizados e avaliados pelo MEC com conceitos sempre positivos. A Instituição oferece 13 cursos de graduação além dos cursos de pós-graduação.

O CEPPE – Centro de Pós-graduação, Pesquisa e Extensão da Funcesi é um canal de abertura permanente  e de oportunidades para o aprofundamento da discussão de temas relevantes. Estimula a extensão como atividade que torna possível um processo voltado para o atendimento das demandas sociais mais prementes.